這次，機器人主腦者派出最先進的T-1000型終結者，回到約翰康納的童年時期，預備殺死約翰，使未來人類世界群龍無首。 約翰康納得知消息，立即派另一名終結者乘坐時光倒流機，趕回現代，保衛童年時期的自己。 在現代，約翰與養父母同住。生母莎拉因言行怪異，且攻擊造成機器人猖厥的電腦公司，因而被當成精神病患，住進病院。 T-1000型殺害瞭約翰的養父母，然後變成養父母外形欲誘殺約翰，幸好終結者趕到，救出約翰。T-1000的另一個目標是莎拉，不料亦遭到終結者和約翰的破壞。 莎拉和約翰決意消滅制造機器主宰者和T-1000型的塞柏電腦公司，一陣惡鬥後，電腦公司被炸成一片火海。然而，T-1000型仍窮追不舍，將莎拉等人逼入鋼鐵廠，並將終結者打成重傷……